بموجب المعاهدة الموقعة بتاريخ 1999/02/04 لتأسيس تجمع دول الساحل والصحراءوإلى نص المادة الرابعة من المعاهدة ، تأسس مصرف الساحل والصحراء بتاريخ 1999/04/14 ليكون أحد أجهزة تجمع دول الساحل والصحراء للقيام بالأعمال التنموية بالإضافة إلى ممارسة نشاط مصرفي مالي أوتجاري وإعطاء الأولوية في ذلك للدول الأعضاء.